据专家分析，黄河承担着全国百分之十二的人口、百分之十五的耕地和五十多座大中城市的供水任务，同时承担着向流域外部分地区远距离调水的重担。因此，建立甘南黄河重要水源补给生态功能区，保护和治理甘南生态环境，涵养水资源，强化水源补给的功能，已成为关系国家生态安全的大事。
是什么使得甘南玛曲这个“黄河的蓄水池”生态环境恶化？大多数专家认为，首要原因是全球气候的变化。甘南玛曲位于东南季风的边缘地带，因而该区域降水丰沛。而由于全球气温变暖使夏季风减弱，该区间的降水持续减少，导致黄河上游天然来水持续十余年减少。
同时，鼠害亦是一大原因。鼠害引起的“黑土滩”越多，草场就越差，草场越差鼠害就越多、越严重，草场破坏的程度也就越大。这一恶性循环，造成甘南高原的生态环境日趋恶化。
再就是人口数量增加，人类在草场过度放牧，森林过度采伐等等。有关专家分析，仅黄河中下游因洪灾或断流造成的损失，有百分之二十以上与甘南及以上地段的植被破坏有关。
甘南黄河重要水源补给区的生态保护意义有多大？作为参与编制并最后修改《规划》专家之一的兰州大学牛叔文教授这样说：“它比三江源的意义更重大，它的意义不能从甘南来看，也不能从甘肃来看。它是黄河的‘蓄水池’，整个黄河流域，大大小小的水电站，沿黄农业的灌溉，生产生活用水，地位很重要。”
甘肃省环保局自然生态处杨泽恩处长是生态保护和建设方面的专家，他近日接受记者采访时说的第一句话就是，“国家很重视《甘南黄河重要水源补给区生态保护与建设规划》。国家今年有三个规划项目，它是三个中的第一个，算是重中之重了。”他介绍说，“目前，国家生态保护与建设示范区，特别是青藏高原的生态示范区就此一家，项目从生态保护切入，最终落在生态保护与经济建设协调发展之上。”
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